新疆盛源种业有限责任公司的前身是五家渠市准噶尔种业有限责任公司。2012年9月在五家渠市准噶尔种业有限责任公司的基础上进行了资产重组。现新疆盛源种业公司由新疆新农现代投资发展有限公司、五家渠市准噶尔种业有限责任公司、新疆芳草湖兴芳资产经营投资有限公司、新疆天佑农业科技发展有限公司、新疆惠远种业股份有限公司和自然人共同出资建设的国有控股,自然人参股的有限责任公司,注册资本总额3000万元,是兵团农业产业化重点龙头企业,拥有大规模国家种子生产基地,技术力量雄厚,拥有较先进的种子加工检验仪器设备。主要经营农作物常规种子,非主要农作物杂交种子生产、繁育、销售。新疆盛源种业有限责任公司下设奇台分公司、芳草湖分公司。